种业是建设“蓝色粮仓”的重要支撑,是现代农业的芯片,是战略性、基础性核心产业。青蟹是我国养殖产量最大的海产经济蟹类之一,具有生长快、肉质鲜美、营养价值高等优点,深受消费者喜爱。然而,目前青蟹人工养殖所需的苗种主要依赖于野外捕捞的天然苗(高达90%以上),这种产业模式存在诸多弊端,严重制约了青蟹养殖业的产业升级和高质量绿色可持续发展。因此,突破当前育种技术瓶颈,加速优良品种培育,对推动我国青蟹种业振兴和养殖业高质量发展具有重要意义。 在国家级及省级科研项目资助下,汕头大学马洪雨教授团队在博瑞迪生物技术有限公司协助下,利用靶向测序分型技术(Genotyping by Pinpoint Sequencing of Captured Targets,cGPS),在高质量参考基因组辅助下,利用全基因组重测序等技术研发了首款青蟹40K cGPS液相育种芯片“蟹芯1号”。该芯片的成功研发将为青蟹全基因组选择育种、全基因组关联分析、重要性状基因挖掘、性别鉴定、遗传多样性分析等研究提供高效可靠的基因型分型平台,对提高育种效率,加速良种创制以及推动我国海水养殖业高质量发展具有重要意义。 基于该团队完成的高质量染色体水平全基因组图谱,利用来自4个不同地理种群的146只的野生个体进行全基因组重测序,从中优选获得40352个高质量的高多态性SNP位点,这些位点在基因组染色体中的覆盖度高、分布均匀、检出率高(平均检出率为97.10%)。该款育种芯片已在全基因组关联分析、全基因组选择育种、种群遗传多样性与发育关系分析等方面得到了广泛应用。 马洪雨教授团队长期致力于青蟹养殖与遗传育种的基础理论与产业应用研究,团队负责人马洪雨教授是国家级专家、广东省领军人才,任广东省环南海地区重要海水养殖品种开发利用国际联合研究中心主任、汕头大学-马来西亚登嘉楼大学虾蟹贝类联合实验室主任,马来西亚登嘉楼大学访问教授、加州理工学院访问学者,入选斯坦福大学2021年度全球前2%顶尖科学家年度科学影响力榜单。马洪雨教授兼任中国青蟹产业技术创新平台副主席、中国水产学会第十一届理事会水产生物技术与遗传育种专业委员会委员、中国青年科技工作者协会第六届理事会理事、广东省青年科学家协会农业科学与技术专业委员会主任、广东水产学会第八届理事会水产养殖技术专业委员会副主任委员。该团队已承担各类科研项目40余项(国家级10项、省部级20余项),发表SCI论文100余篇,获授权国际发明专利1件、国家发明专利13件,发布团体标准1项,转化科研成果1项,荣获中国产学研合作创新成果奖二等奖、中国发明协会发明创业奖创新奖二等奖、第11届澳门国际创新发明展金奖等科技奖励10余项。 文字:叶绍潘、马洪雨 图片:马洪雨教授团队 |